Μεταξύ των άλλων, ο Ντενάρο κατηγορείται ότι ήταν ο εντολοδότης εκρήξεων που είχαν πραγματοποιηθεί, στην δεκαετία του ενενήντα, στην Φλωρεντία, το Μιλάνο και την Ρώμη, αλλά και των δολοφονιών των δικαστικών Πάολο Μπορσελίνο και Τζοβάνι Φαλκόνε, το 1992.
Εδώ και καιρό πάσχει από καρκίνο του παχέος εντέρου και, κατά την σύλληψή του, ο πρώην αρχηγός της Κόζα Νόστρα βρισκόταν έξω από ιδιωτική κλινική του Παλέρμο.
Δεν μετανόησε για το παρελθόν του και δήλωσε, μάλιστα, ότι «αν δεν ήταν άρρωστος, δεν θα τον έπιαναν ποτέ».
Όπως έγινε γνωστό, σεβόμενοι την βούλησή του, οι γιατροί έπαψαν να του παρέχουν τροφή με σωληνάκι.